Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC88CQ9P219 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC88CQ9P219 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms