Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXXC1Q9P0U4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXXC1Q9P0U4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 723.1 ms