Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXC10Q9NYD6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms