Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
IMP3Q9NV31 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
IMP3Q9NV31 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms