Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GINM1Q9NU53 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms