Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB4Q9NTQ9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB4Q9NTQ9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms