Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELLSQ9NRZ9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELLSQ9NRZ9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms