Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDF3Q9NR23 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDF3Q9NR23 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms