Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CD163L1Q9NR16 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CD163L1Q9NR16 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms