Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf4Q9NR00 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C8orf4Q9NR00 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms