Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FZD3Q9NPG1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FZD3Q9NPG1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms