Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms