Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPCPD1Q9NPB8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPCPD1Q9NPB8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms