Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNMB3Q9NPA1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNMB3Q9NPA1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms