Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZCCHC17Q9NP64 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms