Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVK-5Q9HDB9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVK-5Q9HDB9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms