Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAVER2Q9HCJ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAVER2Q9HCJ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms