Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LRRC4Q9HBW1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRRC4Q9HBW1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms