Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LY9Q9HBG7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LY9Q9HBG7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms