Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPF2Q9HAU5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms