Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRDE2Q9H7Z3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms