Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIL1Q9H173 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms