Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC113Q9H0I3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC113Q9H0I3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms