Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP44Q9C0F1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms