Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms