Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT23Q9C075 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT23Q9C075 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms