Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UPF3BQ9BZI7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UPF3BQ9BZI7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms