Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CELF4Q9BZC1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CELF4Q9BZC1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms