Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC94Q9BW85 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC94Q9BW85 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms