Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP58Q9BVL2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP58Q9BVL2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms