Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK1Q9BRS2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms