Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CITED2Q99967 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CITED2Q99967 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms