Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATF6BQ99941 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATF6BQ99941 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms