Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSG101Q99816 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSG101Q99816 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms