Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EYA3Q99504 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EYA3Q99504 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms