Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NMNAT3Q96T66 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMNAT3Q96T66 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms