Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSRNP1Q96S65 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms