Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CICQ96RK0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CICQ96RK0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms