Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC4A9Q96Q91 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms