Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYNGAP1Q96PV0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYNGAP1Q96PV0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms