Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM227BQ96M60 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM227BQ96M60 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms