Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPGRIP1Q96KN7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms