Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VCPIP1Q96JH7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms