Protein–RNA interactions for Protein: Q96J86

CYYR1, Cysteine and tyrosine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYYR1Q96J86 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CYYR1Q96J86 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms