Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms