Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRP36Q96EU6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms