Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EAF2Q96CJ1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EAF2Q96CJ1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms