Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms