Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX21Q969T3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms