Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF34Q969K3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms